По оценке ФНС, излишне перечисленная налоговым агентом сумма НДФЛ (больше фактически удержанного из доходов физических лиц) налогом не является. А значит, агент не может требовать ее зачета и может лишь обратиться с заявлением о ее возврате. ФНС делает такой вывод из следующего пассажа в НК РФ: уплата налога за счет средств налоговых агентов не допускается (Пункт 9 ст. 226 НК РФ). А раз так, то любая переплата НДФЛ, не явившаяся следствием большего, чем нужно, удержания из выплат работникам, не есть излишне уплаченный налог.
Письмо ФНС России от 19.10.2011 N ЕД-3-3/3432@
Мы тут не видим оснований спорить с налоговиками и требовать от них каких-либо иных операций с "переплатой", помимо ее возврата как ошибочно перечисленных в бюджет платежей.
Соответственно, так называемую налоговую подушку по НДФЛ вы создать не сможете - ведь вы даже не можете определить, в счет уплаты налога за какое физическое лицо она могла образоваться. То есть даже при наличии таких переплат оградить себя на будущее от возможных претензий в части пени и штрафа за неудержание НДФЛ вы не сможете.